En lagune er en lav vandmasse beskyttet mod en større vandmasse (normalt havet) af sandstænger, barriereøer eller koralrev. Lagoner kaldes ofte flodmundinger, lyde, bugter eller endda søer.
Kystlagoner
Lagoner beskyttet af sandbarer eller barriereøer kaldes kystlaguner. Kystlaguner dannes langs kystsletter – flade eller let skrånende landskaber. De dannes i områder med små tidevandsområder. Kystlaguner oprettes som et lavt bassin nær kysten eroderer gradvist, og havet siver ind mellem sandstænger eller barriereøer.
Størrelsen og dybden af kystlaguner afhænger ofte af havets overflade. Når havniveauet er lavt, er kystlagunerne sumpede vådområder. Når havniveauet er højt, kan de ligne kystnære søer eller bugter.
De ydre banker er barriereøer langs kysten af de amerikanske stater North Carolina og Virginia. De ydre banker skaber en række laguner kendt som lyde: Currituck Sound, Albemarle Sound og Pamlico Sound. Disse områder er beskyttet mod stormbølger og andre bølger, der ofte banker på kysten i orkanens sæson i Atlanterhavet.
De ydre bredder er faktisk enorme sandstænger. De er ikke forankret til jorden og lider under kystens erosion under storme Beskyttelsen, de tilbyder kyster og laguner, er afgørende for miljøet og økonomien i regionen. Ingeniører overvåger og vedligeholder løbende de ydre bredder ved at uddybe sand fra havbunden for at befæste øerne.
Lagrene i de ydre banker har for det meste brakvand, en blanding af saltvand fra Atlanterhavet og ferskvand fra mange flodmundinger i området. Området er rig på biodiversitet: vandfugle og fisk fra skrubber til bas trives i regionen.
Turismen trives også i De ydre breders kystlaguner. Udover fiskeri nyder de besøgende til lydene sejlads og fritidsaktiviteter som vandski og parasailing.
Laguner med mere beskyttelse mod det åbne hav har en mere ferskvandshabitat. Lake Nokoue, Benin, er en lagune, hvis smalle mund til Atlanterhavet næsten udelukkende er beskyttet af sandstænger. Dens saltholdighed varierer med årstiderne. I regntiden, når floder oversvømmer søen med deres udstrømning, er Lake Nokoue næsten udelukkende ferskvand. I den tørre sæson, når floden langsomt til en ved, og havvand siver ind, har Lake Nokoue et mere brakkt økosystem. Fisk, der er hjemmehørende i Nokoue-søen, såsom tilapia, har tilpasset sig til at overleve i både brak- og ferskvand.

Kystlaguner, som tilbyder beskyttelse mod barske havbølger, bruges ofte som havne. Lake Piso er for eksempel den største sø i det afrikanske land Liberia. Det er en lagune beskyttet mod Atlanterhavet af store barriereøer. Lake Piso blev brugt som en havn for amerikanske vandfly under anden verdenskrig.
Nokoue-søen tilbød en anden type beskyttelse i det 16. og 17. århundrede. Slavehandelstammer fik forbud mod at komme ind i lagunens farvande, så lokale samfund konstruerede en hel by, Ganvie, direkte i vandet. Huse og virksomheder blev bygget på robuste stylter, og transporten var begrænset til både og broer. Indbyggere blev beskyttet mod fangst og slaveri.
Venedig
Byen Venedig, Italien, er bygget på barriereøer og en kystlagune ved Adriaterhavet. Faktisk er Venedigs kaldenavn “Dronningen af Adriaterhavet.”
Den venetianske lagune er det største vådområde i Middelhavet. Den består for det meste af saltvandsmoser og vadehav. To store floder (Sile og Brenta) tømmes ud i lagunen. Dens tynde barriereøer har tre smalle åbninger til Adriaterhavet.
Venedig har dog været en af de største byer i Italien siden fremkomsten af det antikke Rom. Menneskelig aktivitet har radikalt ændret økosystemet i den venetianske lagune.
I dag sidder Venedig på 118 øer. Ikke alle disse øer er naturlige træk ved landskabet. I mere end 500 år har ingeniører og byledere udmudret lagunen for at skabe en række øer og kanaler. Vådområder har også blevet drænet for at skabe jord til boliger og industri.
Venedigs vækst har også drænet akviferen under lagunen og den omkringliggende kyst. Da akviferen faldt sammen, faldt landet over det – Venedig sank. Venedigs lavere højde gjorde det stadig mere sårbare over for s trong årstidens tidevand fra Adriaterhavet.
Artesiske brønde blev forbudt i 1960’erne, og ingeniører har udviklet et sofistikeret tidevandsbarriereprojekt for at reducere nedsænkning og beskytte byen mod oversvømmelser.
Den venetianske lagune er kommet sig. Sænkningen er aftaget, skønt den berømte tidevand (højvand) stadig oversvømmer byen i så meget som 1,5 meter vand hver vinter.

Atollagoner
Atoll laguner ligner kystlaguner. I stedet for at være beskyttet af sandstænger eller barriereøer er atollagunerne imidlertid beskyttet af koralrev.Atoll laguner er meget almindelige i de tropiske farvande i det sydlige Stillehav og det indiske ocean.
Atoll laguner dannes, da koralrev dannes omkring vulkanske øer. I løbet af millioner af år falder øen ned i havet. Ringen af koralrev er imidlertid tilbage. Revene bliver atollen og beskytter en lukket lagune, hvor vulkanen var.
Atollaguner er marine økosystemer. Organismerne, der findes i atollaguner, er normalt de samme, der findes uden for den. På grund af den ringende atoll har mange laguner overhovedet få indfødte arter. Organismer, såsom fisk og gelé, surfer ind, når bølger fra havet styrter over atollen og dumper dem i lagunen. Mange geléarter trives i dette beskyttede miljø, men større rovdyr har få madressourcer.
Atollagunernes vand er ofte en slående lyseblå på grund af deres lave dybde og deres interaktion med kalksten. Koralrev og koralsand er lavet af kalksten, resterne af milliarder af små koraleksoskeletter. Når kalksten udvaskes ind i lagunen, bliver det vandet lystblåt.
Turistindustrien på milliarder dollars i det sydlige Stillehav er afhængig af uberørte strande og lyseblå laguner. Disse atollaguner er også stedet for nogle af de mest intense debatter om klimaændringer og havstigning.
Lagoner og atoller er lavtliggende økosystemer, der er sårbare over for selv den mindste ændring i havoverfladen. Havstigning kunne drukne lagunerne og endda deres ringende atoller. Ønationer som Maldiverne kunne miste ikke kun deres primære industri (turisme), men selve landet. Maldiviske ledere har arbejdet for at bekæmpe havets stigning og erosion ved kysten ved at forfølge internationale aftaler for at begrænse menneskelige bidrag til global opvarmning, opføre bygninger på stylter og endda overveje at evakuere hele befolkningen.