Résumé

Nous avons collecté de manière prospective des données cliniques, de laboratoire et radiographiques concernant le métapneumovirus humain acquis en communauté (hMPV ) infection chez des adultes consécutifs hospitalisés pour pneumonie. L’infection par le hMPV a été diagnostiquée à l’aide d’une analyse par réaction en chaîne par polymérase de transcription inverse très précise d’échantillons nasopharyngés. Huit (4%) des 193 patients présentaient de l’ARN du hMPV, tous détectés pendant la saison grippale. Le hMPV est une cause importante de pneumonie chez les adultes.

Le métapneumovirus humain (hMPV) est un virus respiratoire récemment décrit. La plupart des descriptions des caractéristiques cliniques de l’infection par le hMPV se sont concentrées sur les enfants, bien que l’image chez les adultes émerge lentement. On pense que le hMPV provoque un spectre de maladies chez les adultes, allant de la maladie des voies respiratoires supérieures à la pneumonie communautaire (PAC).

La présentation de la PAC due au hMPV chez les adultes n’a pas été bien caractérisée, et l’incidence peut être sous-estimée. Nous avons entrepris une étude d’étiologie prospective pour mieux décrire les caractéristiques cliniques, radiographiques et de laboratoire et les résultats du hMPV chez des adultes consécutifs hospitalisés pour une PAC.

Méthodes. D’août 2004 à mars 2006, 300 patients consentants consécutifs ont été inscrits dans une étude prospective pour déterminer l’étiologie de la PAC. L’étude comprenait des patients âgés de > 17 ans et qui avaient été hospitalisés en raison de la PAC dans les cinq hôpitaux d’Edmonton, au Canada. Nous avons exclu les patientes enceintes, immunodéprimées (en raison de la réception de > 10 mg de prednisone / jour pendant > 1 mois, réception d’autres agents immunosuppresseurs, ou une infection par le VIH avec un nombre de cellules CD4 de < 250 cellules / µ L), ou qui souffraient de tuberculose ou de fibrose kystique. Tous les patients ont fourni un consentement éclairé écrit et le comité d’éthique de la recherche en santé de l’Université de l’Alberta a approuvé l’étude.

La pneumonie a été définie comme une maladie respiratoire aiguë avec ⩾ 2 des symptômes ou signes suivants: toux, toux productive, fièvre, frissons, dyspnée, douleur thoracique pleurétique, crépitements ou respiration bronchique; en outre, une opacité ou un infiltrat sur la radiographie thoracique interprété comme une pneumonie par un radiologue était nécessaire. La sévérité des symptômes a été notée sur une échelle de 6 points de 0 (aucun symptôme) à 5 (symptôme très sévère), comme décrit ailleurs. Pour caractériser la gravité de la pneumonie elle-même, nous avons calculé l’indice de gravité de la pneumonie à l’aide des méthodes de Fine et al. .

Nous avons prélevé des échantillons de sang et d’expectorations de routine et des écouvillons nasopharyngés pour chaque patient selon un protocole d’étude. Les prélèvements nasopharyngés soumis pour la détection d’agents pathogènes viraux ont d’abord subi des tests viraux de routine selon des algorithmes de test de laboratoire, y compris des tests d’anticorps fluorescents directs pour le virus respiratoire syncytial, le virus parainfluenza et les virus grippaux de types A et B (Imagen; DakoCytomation); cultures rapides sur plaques de virus respiratoires; et les cultures virales traditionnelles. En plus des enquêtes microbiologiques et virologiques de routine, des tests élargis d’échantillons nasopharyngiens ont été effectués pour une gamme d’agents pathogènes respiratoires par des techniques d’amplification d’acide nucléique utilisant des méthodes d’extraction et d’amplification décrites précédemment. En bref, l’extraction d’acide nucléique total (ADN et ARN) a été entreprise à partir de 200 µL de matériel d’écouvillon nasopharyngé dans un volume d’élution de 100 µL avec 5 µL d’acide nucléique élué utilisé dans chaque amplification. Les techniques d’amplification des acides nucléiques comprenaient une RT-PCR conçue pour amplifier et détecter toutes les lignées et sous-lignages du hMPV, ainsi que des dosages sensibles et spécifiques pour le virus de la grippe A, le virus de la grippe B, le virus respiratoire syncytial, les parainfluenzavirus 1 à 4, les adénovirus, les rhinovirus, entérovirus, coronavirus (OC43, 229E et NL63), Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae et Legionella pneumophila. Nous avons inclus tous les patients avec un résultat de RT-PCR positif pour le hMPV dans notre analyse. La limite de détection de la RT-PCR hMPV est < 100 copies d’entrée pour toutes les lignées hMPV, sans réaction croisée signalée avec d’autres pathogènes respiratoires courants (c.-à-d. Spécificité de 100%).

Résultats. Un total de 300 patients ont été enrôlés dans l’étude, et 193 ont eu des échantillons de nasopharynx évaluables collectés; ce dernier groupe est notre dernier échantillon d’étude. Dans l’ensemble, 9 patients avaient des preuves d’ARN du hMPV détecté dans l’écouvillon nasopharyngé; 1 présentait des signes de coinfection (Streptococcus pneumoniae détecté par hémoculture) et a donc été exclu de l’analyse. Huit (4%) des 193 patients avaient de l’ARN du hMPV détecté sans signe de co-infection avec d’autres micro-organismes (c.-à-d., aucun organisme n’a été cultivé à partir d’échantillons de sang ou de crachats ou détecté par un prélèvement nasopharyngé sur écouvillon) et ont été considérés comme ayant hMPV CAP. Tous les cas d’infection par le hMPV sont survenus entre décembre et avril.

Les caractéristiques des 8 patients atteints de PAC due au hMPV sont résumées dans le tableau 1. L’âge variait de 31 à 91 ans (moyenne, 62 ans ), 5 (63%) des 8 patients étaient des femmes et tous les patients avaient une maladie cardiaque ou pulmonaire sous-jacente. La moitié des patients avaient une pneumonie sévère (définie comme un indice de gravité de la pneumonie de classe IV ou V).

Tous les patients atteints de pneumonie due au hMPV souffraient de toux, de dyspnée et de fatigue. La toux a été décrite par les 8 patients comme «suffisamment sévère pour nécessiter des antitussifs», et une toux productive a été décrite par 6 patients; 5 ont décrit leurs expectorations comme purulentes. La dyspnée a été décrite comme «au moins la plupart du temps» chez 4 patients . Sept patients ont rapporté que leur fatigue consistait à être «fatigués la plupart du temps, à l’aise uniquement au repos». À noter, un seul patient avait des myalgies et un seul avait une maladie gastro-intestinale.

Un seul patient était fébrile (température buccale, > 38 ° C), et la température moyenne des 8 patients était de 37,6 ° C (intervalle de 36,2 ° C à 40,4 ° C). La fréquence respiratoire moyenne était de 25 respirations / min (intervalle de 20 à 36 respirations / min), mais un seul patient était tachypnéique ( définie comme une fréquence respiratoire de > 30 respirations / min). Néanmoins, la plupart des patients étaient hypoxiques, et seuls 2 sur 8 présentaient des saturations en oxygène dans l’air ambiant de > 92%. La fréquence cardiaque moyenne était de 103 battements / min (de 73 à 116 battements / min) et aucun patient n’avait une pression artérielle systolique de < 90 mm Hg .

Des infiltrats pouvaient être observés dans les lobes supérieurs (3 patients), médians (4 patients) ou inférieurs (5 patients) des radiographies thoraciques à l’admission, et chez 50% des patients, les radiographies ont démontré anomalies multilobaires. Seuls 3 patients avaient des infiltrats bilatéraux. Petite plèvre unilatérale Des épanchements ont été observés chez 4 patients.

Tous les patients ont reçu un traitement empirique à la lévofloxacine, conformément à la carte des soins de pneumonie des hôpitaux. La durée moyenne du séjour était de 7 jours (de 2 à 11 jours); aucun patient n’a nécessité d’intubation, de ventilation ou d’admission à l’unité de soins intensifs, et aucun patient n’est décédé.

Discussion. Dans cette étude de cohorte prospective, nous avons constaté que le hMPV représentait 4% de tous les cas de PAC, et qu’il était plus fréquent pendant les mois d’hiver (le pic habituel de l’activité grippale) et avait tendance à affecter les patients âgés atteints de troubles cardiopulmonaires. Nous avons montré que la prévalence de la pneumonie hMPV était similaire à la prévalence de 4,4% précédemment rapportée de la pneumonie à virus respiratoire syncytial chez les adultes. Nos résultats sont cohérents avec ceux de Hamelin et al. , qui ont rapporté que l’incidence de l’infection par le hMPV chez les patients atteints de PAC ou d’exacerbations de maladie pulmonaire obstructive chronique était de 4,1%, bien que la population de leur étude comprenait des patients présentant des preuves de co-infection avec d’autres agents pathogènes.

la pneumonie dans notre échantillon comprenait une toux sévère (souvent productive), une dyspnée, de la fatigue et l’absence de fièvre, ce qui correspond à la plupart des rapports de cas précédents et de petites études de cas d’infection par le hMPV chez les adultes. En revanche, Hamelin et al. ont décrit la fièvre comme un signe important chez les patients atteints de PAC due au hMPV (encore une fois, gardez à l’esprit qu’ils comprenaient des patients présentant des agents pathogènes co-infectants potentiels, tels que S. pneumoniae et le virus de la grippe). Dans notre série de patients sans co-infection détectable, la pneumonie hMPV semblait se distinguer de la grippe en raison de l’absence de fièvre, de myalgies et de symptômes gastro-intestinaux – des symptômes qui, selon la littérature précédente, devraient jouer un rôle important dans la grippe. Si cette observation devait être reproduite lorsqu’elle était étudiée dans une cohorte plus large, une reconnaissance plus précoce de la PAC due au hMPV pourrait aider à éviter l’utilisation d’antiviraux empiriques inutiles.

Le résultat de la PAC due au hMPV dans cette étude était bon; aucun patient n’est décédé ou n’a dû être admis dans une unité de soins intensifs. En revanche, l’infection par hMPV chez les hôtes immunodéprimés a été associée à une morbidité et une mortalité significatives. Un diagnostic d’infection par le hMPV peut avoir des implications importantes sur le contrôle de l’infection, car les hôpitaux voudront éviter de placer des patients atteints de CAP connue en raison du hMPV avec ceux qui sont immunodéprimés. Ceci est pertinent, étant donné les rapports récents selon lesquels le hMPV est une cause d’épidémies d’infection respiratoire dans les écoles, les établissements de soins de longue durée et les centres de soins assistés.

Les points forts de cette étude incluent ses données prospectives et complètes collectées auprès d’une cohorte de patients consécutifs nécessitant une hospitalisation. La taille de notre échantillon empêche des comparaisons statistiques significatives avec le reste de la cohorte de l’étude; cependant, notre intention était de décrire l’entité clinique et non de comparer sa présentation avec celle des pneumonies dues à d’autres étiologies. Les limites incluent le fait que les patients ont été recrutés dans seulement 5 hôpitaux et la possibilité de diagnostics de hMPV faux négatifs et faux positifs, bien que la RT-PCR aurait une excellente sensibilité et spécificité, et une publication récente de Falsey et al. a conclu que le portage asymptomatique du hMPV est extrêmement rare. Il est possible que certains patients aient eu une surinfection bactérienne, bien que le fait que la fièvre soit absente et que les globules blancs soient normaux atténue potentiellement cela. La co-infection virale était peu probable, étant donné l’utilisation de la RT-PCR pour exclure de nombreux virus potentiels.

En résumé, le hMPV est une cause fréquente de pneumonie chez les adultes, constituant 4% de tous les cas de PAC dans notre cohorte. Nous recommandons des tests de routine pour le hMPV chez les adultes admis à l’hôpital avec CAP alors que le virus est connu pour être en circulation, car une détection précoce peut aider à limiter la transmission du hMPV, en particulier aux hôtes immunodéprimés.

Remerciements

Nous remercions Carol Mangan, notre infirmière de recherche, pour sa précieuse contribution.

Soutien financier. Alberta Heritage Foundation for Medical Research (AHFMR) et les Instituts de recherche en santé du Canada (soutien salarial à S.R.M.); subvention d’établissement de l’AHFMR à T.J.M.

Conflits d’intérêts potentiels. Tous les auteurs: pas de conflits.