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Cerca sovvenzioni NIH dalla riga di comando

Settembre 15, 2020
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Lo strumento NIH RePORTER è un ottimo strumento per interrogare i record delle sovvenzioni e le dichiarazioni di riepilogo del progetto. Trovo utile avere una buona idea sui progetti di ricerca con interessi condivisi, chi è chi negli esperti di dominio e sulle tendenze attuali per il finanziamento della ricerca ad alto impatto. Se preferisci la riga di comando rispetto all’interfaccia del sito Web per la ricerca rapida, NIH fornisce un’eccellente interfaccia API per interrogare il database RePORTER. Ho creato un’utilità bash, grantfinder per interrogare l’API di RePORTER. 🙌

Ad esempio, puoi cercare per nome PI (-p) o query di testo (-q) che può cercare i termini del progetto, il titolo del progetto e gli abstract. Gli argomenti rimanenti sono facoltativi.

Installazione

Per intall grantfinder, scarica l’utilità bash e posizionala in PATH, in genere nella tua cartella ~/bin/.

Poiché grantfinder richiede la query dell’API RePORTER e l’analisi dell’output JSON, avrai bisogno dei seguenti strumenti in PATH .

  • http: client 1 dell’API della riga di comando.
  • jq: È come sed per JSON2.
  • bat: cat come comando ma con output3 fantasia. Se non lo desideri, sostituisci bat con cat nello script grantfinder.

Limitazioni

Per ora, l’API limita i record a un massimo di 50 indipendentemente dall’argomento offset (-i). Controlla la documentazione API4 per ulteriori opzioni.

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