門脈系は、胃腸管の一部から肝臓に血液を送る役割を果たします。小腸に吸収された物質は、心臓に進む前に、処理のために最初に肝臓に移動します。すべての胃腸管がこのシステムの一部であるわけではありません。このシステムは、食道のほぼ下部から肛門管の上部まで伸びています。脾臓や膵臓からの静脈ドレナージも含まれます。

腸内の食物から吸収された物質が体循環に入る前に肝臓を通過するファーストパス代謝の進化の目的は、肝臓を使用することです。 （a）食物、その毒素（それらが何であれ）、およびその代謝中間体/代謝物（アンモニアなど）と（b）体の残りの組織との間のシールド（防御の第一線）として、このようなシステムの必要性は、循環器系の進行した肝線維症が、アンモニアやその他の助長しない物質を血液に負荷しているために脳の肝脳症につながるときに見られるように、システムが故障したときに何が起こるかによって示されます脳機能。

肝臓への血流は、酸素化された血液と（部分的に）脱酸素化された血液の両方を受け取るという点で独特です。その結果、酸素の部分ガス圧（pO2）と門脈血の灌流圧は他の臓器よりも低いo f体。血液は門脈の枝から、類洞と呼ばれる肝細胞の「プレート」の間の空洞を通過します。血液はまた、肝動脈の枝から流れ、正弦波に混ざり合って肝細胞に酸素を供給します。この混合物は類洞を通って浸透し、肝静脈に排出される中心静脈に集まります。その後、肝静脈は下大静脈に流れ込みます。

肝動脈は肝臓に酸素の30〜40％を供給しますが、肝臓の総血流量の25％しか占めていません。残りは門脈からの部分的に脱酸素化された血液から来ています。肝臓は、安静時に全身の酸素の約20％を消費します。そのため、肝臓の総血流量は非常に多く、1分あたり約1リットル、1分あたり最大2リットルです。これは、安静時の平均心拍出量の平均4分の1です。