手紙

Horvatらによる論文「Ochrobactrumanthropi感染と誤認されたブルセラ感染のリボソームRNA配列分析」を興味深く読んだ（1 ）この論文は、ブルセラ分離株がOchrobactrum anthropiと誤認されたことを報告しました。16SrRNAの結果は、分離株がブルセラ種であり、既知のブルセラのrRNA配列と100％一致し、Ochrobactrumanthropi配列との相同性が低いことを示しました。

私たちの研究室は2011年12月以来3回このような状況に遭遇しました。明らかな原因のない熱に苦しむ2人の患者の血液培養と左脛骨病変のある患者の骨髄培養から菌株が分離されました。最初はBordetellaと同定されました。 Vitek 2 Compact微生物識別システムとグラム陰性（GN）識別カードを介したbronchiseptica（1例）とOchrobactrum anthropi（2例）最初のケースとして（m Bordetella bronchisepticaとして識別されます）は、脾腫のブルセラ症症状、軽度のトランスアミナーゼの上昇、典型的な波状熱、および白血球数のリンパ球レベルの有意な上昇を示し、16S rRNA PCR増幅および配列決定を行い、GenBank（アクセッション番号ACBJ01000075）を使用して結果を分析しました。 .1、ACEM01000005.1、NC_013118.1、およびNC_009668.1）。結果は、最高レベルの同一性は、ブルセラ属菌の中でブルセラ・アボートス、ブルセラ・メリテンシス、およびブルセラ・ミクロチ、ならびにオクロバクトラム・アンスロピATCC 49188（クエリカバレッジ、100％;最大同一性、99％）であることを示した。ただし、Ochrobactrum anthropiは、半固体-中程度の運動性試験およびべん毛染色で観察された陰性結果に基づいて除外することができます。結果は、自動化された微生物同定システムが信頼できないことを示唆しているので、VitekテストによってOchrobactrum anthropiとして同定された2つの保存菌株を継代培養し、再評価しました。 16S rRNA PCR増幅、シーケンシング、およびアラインメントが実行されました。結果は最初の菌株の結果と同様でした。つまり、最高の同一性は、ブルセラ属菌内のいくつかの分離株に対するものでした。およびOchrobactrumanthropi。ここでも、Ochrobactrum anthropiは、半固体-中程度の運動性試験とべん毛染色からの陰性結果に基づいて除外されました。また、リアルタイムPCRとそれに続く高分解能融解（HRM）曲線分析を利用して、ブルセラ菌株を特定するテストを実施しました。それらはブルセラメリテンシスとして同定されました。 3つの菌株はすべて中国CDCによってブルセラメリテンシスとして確認され、患者の血清はブルセラ微小凝集試験を使用してブルセラ抗体に陽性でした。これらの3つの染色は、バイオバールタイプIとして血清型決定されました。

ブルセラは潜在的ですバイオテロの病原体であり、実験室で獲得した感染症を引き起こす重大な病原体でもあります（2、3）。ただし、一部の市販の細菌識別システムによるブルセラ属菌の誤認は以前に報告されています（4、5）。これらの誤認が繰り返されるため、ますます研究所は現在、ブルセラを同定するために分子法に依存しています。Horvatと同僚による報告に加えて、Gee et al。による研究は、6種の65のブルセラ株が配列決定され共有された後に生成されたブルセラ種16SrRNAコンセンサス配列を示しました。 B.melitensis株16MおよびB.suis株1330を含むGenBankの11のブルセラ16SrRNA遺伝子配列と100％の同一性（6）。これらの結果は、 16S rRNA遺伝子シーケンシング法は、成長の遅いグラム陰性桿菌を臨床的に同定する効率的な手段ですが、ブルセラ属菌との99％の一致と比較して、Ochrobactrumanthropiとの相同性が完全に欠如していることに深刻な懸念があります。または、ここで報告されているOchrobactrum anthropi株（ATCC株を含む）。これは、異なるデータベース（SmartGeneとGenBank）の使用に関連していますか？ブルセラメリテンシスなどの成長の遅い細菌を特定するために16SrRNA配列分析をより有効に活用するために、Horvatと同僚からの返信を楽しみにしています。