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우리는 Horvat와 동료들이 쓴 “Ochrobactrum anthropi Infection으로 잘못 식별 된 Brucella 감염의 리보솜 RNA 서열 분석”논문을 흥미롭게 읽었습니다. 논문은 Brucella 분리 주가 Ochrobactrum anthropi로 잘못 식별되었다고보고했습니다. 16S rRNA 결과는 분리가 Brucella 종으로 알려진 brucellae의 rRNA 염기 서열과 100 % 일치하고 Ochrobactrum anthropi 염기 서열과는 낮은 상 동성을 나타 냈습니다.

우리 실험실은 2011 년 12 월 이후 세 차례 이러한 상황에 직면했습니다. 명백한 원인없이 열을 앓고있는 2 명의 환자의 혈액 배양과 왼쪽 경골 병변이있는 환자의 골수 배양에서 균주를 분리했습니다. 처음에는 Bordetella로 확인되었습니다. Vitek 2 Compact 미생물 식별 시스템과 그람 음성 (GN) 신분증을 통한 bronchiseptica (1 건) 및 Ochrobactrum anthropi (2 건) 첫 번째 사례 (m Bordetella bronchiseptica로 확인 됨) 비장 비대증의 브루셀라증 증상, 경미하게 상승 된 트랜스 아미나 제, 전형적인 불변 열 및 백혈구 수에서 유의하게 상승 된 림프구 수준을 보였으며, 16S rRNA PCR 증폭 및 시퀀싱을 수행하고 결과를 GenBank (수탁 번호 ACBJ01000075)를 사용하여 분석했습니다. .1, ACEM01000005.1, NC_013118.1 및 NC_009668.1). 결과에 따르면 Brucella abortus, Brucella melitensis 및 Brucella microti는 Brucella 종과 Ochrobactrum anthropi ATCC 49188 (쿼리 범위, 100 %, 최대 ID, 99 %) 중에서 가장 높은 수준의 정체성을 나타 냈습니다. 그러나 Ochrobactrum anthropi는 반고체-중간 운동성 검사 및 편모 염색에서 관찰 된 음성 결과에 따라 제외 될 수 있습니다. 결과는 자동화 된 미생물 식별 시스템이 신뢰할 수 없음을 시사하므로 Vitek 테스트에 의해 Ochrobactrum anthropi로 확인 된 두 개의 보존 된 균주가 계대 배양되고 재평가되었습니다. 16S rRNA PCR 증폭, 시퀀싱 및 정렬을 수행했습니다. 결과는 첫 번째 균주의 결과와 유사했습니다. 즉, 가장 높은 정체성은 Brucella spp. 및 Ochrobactrum anthropi. 여기서도 Ochrobactrum anthropi는 반고체-중간 운동성 테스트 및 편모 염색의 음성 결과에 따라 제외되었습니다. 또한 Brucella 균주를 식별하기 위해 실시간 PCR 후 고해상도 용융 (HRM) 곡선 분석을 사용하는 테스트를 수행했습니다. 그들은 Brucella melitensis로 확인되었습니다. 세 균주 모두 중국 CDC에 의해 Brucella melitensis로 확인되었으며 환자의 혈청은 Brucella microagglutination 테스트를 사용하여 Brucella 항체에 양성이었습니다.이 세 가지 염색은 biovar type I로 혈청 형이 지정되었습니다.

Brucella가 잠재적입니다. 생물 테러의 인자이자 실험실 감염을 유발하는 중요한 병원체입니다 (2, 3). 그러나 일부 상업용 박테리아 식별 시스템에 의한 Brucella 종의 오인식은 이전에보고되었습니다 (4, 5). 이러한 반복적 인 오식으로 인해 점점 더 많은 실험실은 현재 Brucella를 확인하기 위해 분자 방법에 의존하고 있습니다. Horvat 및 동료의 보고서 외에도 Gee 등의 연구에 따르면 6 종의 Brucella 균주 65 개가 시퀀싱되고 공유 된 후에 생성 된 Brucella 종 16S rRNA 컨센서스 서열이 확인되었습니다. B. melitensis 균주 16M 및 B. suis 균주 1330을 포함한 GenBank의 11 개의 Brucella 16S rRNA 유전자 서열과 100 % 동일성 (6). 16S rRNA 유전자 시퀀싱 방법은 느리게 성장하는 그람 음성 간균을 임상 적으로 식별하는 효율적인 수단이지만, Brucella 종과 99 % 일치하는 것과 비교하여 Ochrobactrum anthropi와의 완전한 상 동성 부재와 관련하여 심각한 우려가 있습니다. 또는 여기에보고 된 Ochrobactrum anthropi 균주 (ATCC 균주 포함). 다른 데이터베이스 (SmartGene 대 GenBank)의 사용과 관련이 있습니까? Brucella melitensis와 같은 느리게 성장하는 박테리아를 식별하기 위해 16S rRNA 서열 분석을 더 잘 활용할 수 있도록 Horvat 및 동료의 답변을 기대합니다.