Een lagune is een ondiepe watermassa die wordt beschermd tegen een grotere hoeveelheid water (meestal de oceaan) door zandbanken, barrière-eilanden of koraalriffen. Lagunes worden vaak estuaria, geluiden, baaien of zelfs meren genoemd.
Kustlagunes
Lagunes die worden beschut door zandbanken of barrière-eilanden worden kustlagunes genoemd. Kustlagunes vormen zich langs kustvlaktes – vlakke of licht glooiende landschappen. Ze vormen zich in gebieden met kleine getijdenverschillen. Kustlagunes worden gecreëerd als een ondiep bassin nabij de kust geleidelijk erodeert en de oceaan sijpelt tussen de zandbanken of barrière-eilanden in.
De grootte en diepte van kustlagunes zijn vaak afhankelijk van het zeeniveau. Als de zeespiegel laag is, zijn kustlagunes moerassige wetlands. Als de zeespiegel hoog is, kunnen ze eruit zien als kustmeren of baaien.
De Outer Banks zijn barrière-eilanden langs de kust van de Amerikaanse staten North Carolina en Virginia. De Outer Banks creëren een reeks lagunes die bekend staan als geluiden: Currituck Sound, Albemarle Sound en Pamlico Sound. Deze gebieden zijn beschut tegen stormvloeden en andere golven die vaak op de kust beuken tijdens het orkaanseizoen van de Atlantische Oceaan.
De Outer Banks zijn eigenlijk enorme zandbanken. Ze zijn niet verankerd aan de aarde en lijden onder kusterosie tijdens stormen . De bescherming die ze de oevers en lagunes bieden, is van vitaal belang voor het milieu en de economie van de regio. Ingenieurs monitoren en onderhouden de Outer Banks voortdurend door zand van de zeebodem te baggeren om de eilanden te versterken.
De lagunes van de Outer Banks hebben meestal brak water, een mix van zout water uit de Atlantische Oceaan en zoet water uit vele riviermondingen in het gebied. Het gebied is rijk aan biodiversiteit: watervogels en vissen van bot tot baars gedijen in de regio.
De toeristenindustrie gedijt ook goed in de regio kustlagunes van de Outer Banks. Naast vissen, genieten bezoekers van de geluiden van varen en recreatieve activiteiten zoals waterskiën en parasailen.
Lagunes met meer bescherming tegen de open oceaan hebben een meer zoetwaterhabitat. Lake Nokoue, Benin, is een lagune waarvan de smalle monding naar de Atlantische Oceaan bijna volledig wordt beschermd door zandbanken. Het zoutgehalte varieert met de seizoenen. Tijdens het regenseizoen, wanneer rivieren het meer overstromen met hun uitstroom, is Lake Nokoue bijna volledig zoet water. Tijdens het droge seizoen, wanneer de rivier langzaam stroomt en zeewater naar binnen sijpelt, heeft Lake Nokoue een meer brak ecosysteem. Vissen die inheems zijn in Lake Nokoue, zoals tilapia, hebben zich aangepast om te overleven in zowel brak als zoet water.

Kustlagunes, die bescherming bieden tegen ruwe oceaangolven, worden vaak gebruikt als havens. Het Piso-meer is bijvoorbeeld het grootste meer van het Afrikaanse land Liberia. Het is een lagune die door grote barrière-eilanden wordt beschermd tegen de Atlantische Oceaan. Lake Piso werd tijdens de Tweede Wereldoorlog gebruikt als haven voor Amerikaanse watervliegtuigen.
Lake Nokoue bood in de 16e en 17e eeuw een ander soort bescherming. Slavenhandelaars mochten de wateren van de lagune niet betreden, dus bouwden lokale gemeenschappen een hele stad, Ganvie, direct in het water. Huizen en bedrijven werden gebouwd op stevige palen en het vervoer was beperkt tot boten en bruggen. Inwoners werden beschermd tegen gevangenneming en slavernij.
Venetië
De stad Venetië, Italië, is gebouwd op barrière-eilanden en een lagune aan de kust van de Adriatische Zee. De bijnaam van Venetië is eigenlijk “Koningin van de Adriatische Zee”.
De lagune van Venetië is het grootste moerasgebied in de Middellandse Zee. Het bestaat voornamelijk uit zoutwatermoerassen en slikken. Twee grote rivieren (de Sile en de Brenta) komen uit in de lagune. De dunne barrière-eilanden hebben drie smalle openingen naar de Adriatische Zee. Venetië is echter een van de grootste steden in Italië sinds de opkomst van het oude Rome. Menselijke activiteit heeft het ecosysteem van de lagune van Venetië radicaal veranderd.
Tegenwoordig ligt Venetië op 118 eilanden. Niet al deze eilanden zijn natuurlijke kenmerken van het landschap. Al meer dan 500 jaar hebben ingenieurs en stadsleiders de lagune gebaggerd om een reeks eilanden en kanalen te creëren. Wetlandgebieden hebben ook drooggelegd om land voor huisvesting en industrie te creëren.
De groei van Venetië heeft ook de watervoerende laag onder de lagune en de omliggende kust leeggemaakt. Naarmate de watervoerende laag kromp, zakte het land erboven af – Venetië zonk. De lagere ligging van Venetië maakte het steeds kwetsbaarder voor s trong seizoensgebonden getijden van de Adriatische Zee.
Artesische bronnen werden in de jaren zestig verboden en ingenieurs hebben een geavanceerd project voor getijdenbarrières ontwikkeld om bodemdaling te verminderen en de stad te beschermen tegen overstromingen.
De lagune van Venetië is hersteld. De bodemdaling is vertraagd, hoewel het beroemde aqua alta (hoogwater) getij de stad elke winter nog steeds met wel 1,5 meter water onder water zet.

Atolllagunes
Atolllagunes zijn vergelijkbaar met kustlagunes. In plaats van te worden beschut door zandbanken of barrière-eilanden, worden atollagunes beschermd door koraalriffen.Atollagunes komen veel voor in de tropische wateren van de Stille Zuidzee en de Indische Oceaan.
Atollagunes worden gevormd als koraalriffen rond vulkanische eilanden. Gedurende miljoenen jaren zakt het eiland in de oceaan. De ring van koraalriffen blijft echter bestaan. De riffen worden het atol en beschermen een ingesloten lagune waar vroeger de vulkaan was.
Atollagunes zijn mariene ecosystemen. De organismen die in atollagunes worden aangetroffen, zijn meestal dezelfde die erbuiten worden aangetroffen. Vanwege het ringatol hebben veel lagunes helemaal geen inheemse soorten. Organismen, zoals vissen en gelei, komen naar binnen terwijl golven van de oceaan over het atol slaan en dumpen in de lagune. Veel soorten gelei gedijen goed in deze beschermde omgeving, maar grotere roofdieren hebben weinig voedsel.
Het water van atollagunes is vaak opvallend lichtblauw vanwege hun geringe diepte en hun interactie met kalksteen. Koraalriffen en koraalzand zijn gemaakt van kalksteen, de overblijfselen van miljarden kleine koraalexoskeletten. Terwijl kalksteen in de lagune lekt, wordt het water helderblauw.
De miljardensector in de Stille Zuidzee vertrouwt op ongerepte stranden en helderblauwe lagunes. Deze atollagunes zijn ook de locatie van enkele van de meest intense debatten over klimaatverandering en zeespiegelstijging.
Lagunes en atollen zijn laaggelegen ecosystemen die kwetsbaar zijn voor zelfs de kleinste verandering van de zeespiegel. Stijging van de zeespiegel zou de lagunes en zelfs hun ringatollen kunnen verdrinken. Eilandstaten zoals de Malediven zouden niet alleen hun primaire industrie (toerisme) kunnen verliezen, maar ook het land zelf. Maldivische leiders hebben gewerkt om de zeespiegelstijging en kusterosie tegen te gaan door internationale overeenkomsten na te streven om menselijke bijdragen aan de opwarming van de aarde te beperken, gebouwen op palen te bouwen en zelfs te overwegen om de hele bevolking te evacueren.