Deși întrebarea este de obicei folosită metaforic, biologia evoluționistă oferă răspunsuri literale, făcute posibile prin principiul darwinian că speciile evoluează în timp și, astfel, găinile aveau strămoși care nu erau pui , similar cu punctul de vedere exprimat de filosoful grec Anaximandru când a abordat paradoxul.

Dacă întrebarea se referă la ouă în general, oul a venit pe primul loc. Primul ou amniot – adică un ou cu coajă tare care ar putea fi depus pe uscat, mai degrabă decât să rămână în apă ca ouăle de pește sau amfibieni – a apărut în urmă cu aproximativ 312 milioane de ani. În schimb, puii sunt descendenți domestici ai păsărilor jungle roșii și probabil au apărut cu puțin mai mult de opt mii de ani în urmă, cel mult.

Dacă întrebarea se referă în mod specific la ouăle de pui, răspunsul este totuși oul, dar explicația este mai complicat. Procesul prin care puiul a apărut prin încrucișarea și domesticirea mai multor specii de păsări sălbatice de junglă este puțin înțeles, iar punctul în care acest organism în evoluție a devenit pui este o distincție oarecum arbitrară. Indiferent de criteriile pe care le alegeți, un animal aproape identic cu puiul modern (adică un proto-pui) a depus un ovul fertilizat care avea ADN identic cu puiul modern (datorită mutațiilor din ovulul mamei, sperma tatălui, sau zigotul fertilizat). Mai simplu spus de Neil deGrasse Tyson: „Care a fost primul: puiul sau oul? Oul – depus de o pasăre care nu era un pui.”

S-a sugerat că acțiunile unei proteine găsite în ouăle moderne de pui pot face răspunsul diferit. În uter, puii produc ovocleidin-17 (OC-17), care determină formarea cojii îngroșate de carbonat de calciu din jurul ouălor. Deoarece OC-17 este exprimat de găină și nu de ou, pasărea în care a apărut prima dată proteina, deși a ieșit dintr-un ou neîntarit, ar fi depus primul ou având o astfel de coajă întărită: puiul ar avea a precedat acest prim ou de pui „modern”. Cu toate acestea, prezența OC-17 sau a unui omolog la alte specii, cum ar fi curcanii și cintezii, sugerează că astfel de proteine care întăresc coaja de ou sunt comune tuturor păsărilor și, prin urmare, precedă mult timp primele găini.